政府在食品安全體系建設與運行中扮演重要角色，但是，農產品食品安全工作僅僅靠政府是遠遠不夠的。在歐美等發(fā)達國家，通過第三方認證機構的認證活動來加強農產品、食品生產和經營企業(yè)安全體系的建設已經成為保障食品安全的重要手段，同時也降低了行政成本，有利于分散行政風險。
我國《農產品質量安全法》已經于2006年11月1日實行，為保障農產品質量安全，維護公眾健康，促進農業(yè)和農村經濟發(fā)展提供了法律保證?！掇r產品質量安全法》在第8條和第9條中，明確指出國家引導、推廣標準化生產，鼓勵和支持生產優(yōu)質農產品，推行科學的質量管理辦法。
認證是當前國際通行的農產品和食品質量安全管理手段，其最具有特色且起著重要作用的功能在于：
一是有利于推進標準化的貫徹實施，便于規(guī)范農產品種養(yǎng)過程及食品加工、銷售等環(huán)節(jié)，促使農產品及食品的生產者、經營者及相關管理者樹立標準意識和質量意識。
二是判定農產品、食品是否符合標準，是由處于公正地位的專業(yè)化的認證機構作出的。它以不同于農產品種植、養(yǎng)殖方和食品加工方（即第一方）與批發(fā)商、經銷商（即第二方）的第三方身份，對獲得認證的產品持續(xù)符合標準和技術規(guī)范的要求提供證明，并承擔保障認證結果公正和有效的責任。
三是有利于解決當前國際農產品及食品貿易遇到的技術壁壘，通過農產品、食品認證的國際互認，便于我國農產品、食品順利走出國門。
四是開展認證適應了政府職能轉變和機構改革形勢，有利于政府從直接實施產品質量安全檢驗檢測等行政審批性質（直接承擔著質量安全的責任）的工作中解脫出來，減少政府的責任和風險，因而對于深化行政管理體制改革，提高政府效能，從源頭上預防和治理腐敗，也具有重要意義。
目前，我國管理農產品、食品質量安全的方式方法有很多。專家建議，應對我國農產品認證制度進行整合，按照農產品、食品生產供應鏈建立我國農產品和食品質量安全認證的框架。同時，實施現(xiàn)有的無公害農產品、綠色食品、有機食品認證制度，既滿足一般消費者對質量安全的基本要求，又適應不同消費層次比較高的要求。
